在分区时即指定让硬盘使用FAT32或者用一些转换程序将硬盘由FAT16转为FAT32，这样不但可以通过更高效地存储数据以节省磁盘空间（大约10%-15%），而且还可以改善磁盘的性能，在使用较少的系统资源的情况下使程序运行加快50%。

　　实现方法：在Windows 98中，单击“开始-程序-附件-系统工具-驱动器转换器（FAT32）”，然后按操作说明一步步进行即可。

　　5、让硬盘和光驱始终使用32位的工作模式

　　由于某些原因（如病毒感染或加载了某些实模式驱动程序等）会使Windows 98的硬盘和光驱工作在MS-DOS兼容模式下，以致严重影响了两者的读写速度，此时就要设法恢复它们的32位工作模式。

　　实现方法：首先删除Config.sys文件中的实模式驱动程序，然后在“控制面板”中单击“系统-性能-文件系统-疑难解答”，并检查一下是否选取了“禁用32位保护模式的磁盘驱动程序”复选框，如果已经选取，取消它即可恢复32位工作模式；如果没有选取，则说明系统中的32位磁盘驱动程序已经丢失或出现故障。

　　解决办法是： 在“控制面板”中单击“系统-设备管理器-系统设备-即插即用BIOS”，选取“删除”按钮，并选择重新启动计算机，然后系统将自动运行“添加新硬件向导”，并重新为检测到硬件配备驱动程序，包括硬盘、软驱和光驱，从而可以恢复磁盘的32位工作模式，但在这过程中要注意：为新硬件安装驱动程序时需要Windows 98的安装光盘，但此时光驱却不可用（系统不能自动支持），这就要求你要么先配置好Config.sys和Autoexec.bat文件（在其中加入光驱的驱动程序），要么先把系统安装光盘上的文件拷贝到硬盘上。

　　6、定期整理硬盘上的文件碎片

　　硬盘是系统中使用最频繁的部件之一，大量的文件操作（新建、复制、删除等）将使文件存储不连续，导致读文件时间越来越长，此时就需要使用Windows 98提供的“磁盘碎片整理程序”进行整理了，它不但可以重新整理硬盘上文件和未使用的空间，以加速文件的读取和程序的运行，更可以监控各种软件加载的频度，并据此将最常用的应用程序放到存取最快的磁盘位置，以尽可能减少硬盘寻道所用的时间，从而使程序取得最快的装入速度。