其中，autoexec.bat与config.sys是DOS时代的两个系统配置文件，在Windows 98则是可有可无，而且如果你不需要在纯DOS下做必要的工作，那么这两个文件可以不要，这样可加快系统的启动，减少资源占用率。
五、加快系统启动速度
1、用系统配置程序定制自动选项。
单击“开始”按钮，选择“运行”，在“打开”输入框内输入msconfig，单击“确定”按钮启动系统配置实用程序，单击“常规”标签项，选定“选择性启动”单选框，在此单选框内只选定“处理System.ini文件”和“处理Win.ini文件”这两个复选框。单击“启动”标签项，这个方框内只选择“ScanRegistry C:\Windows\scanregw.exe /autorun”和需要进行实时监控的防病毒程序等。
2、删除一些自动加载的程序。
Windows98在启动时会自动加载一些程序，随着Windows下安装的程序的增多，特别是一些程序在Windows启动时也跟着运行，影响了Windows系统的运行速度。因此我们可以合理地配置这些启动程序，删除一部份不必要自动加载的程序。
“启动”组中的程序可以通过在“启动”组中指到要删除的启动项，点击鼠标右键进行删除。
注册表中的自动加载程序，可以通过修改注册表来删除。运行注册表编辑器Regedit，点击并展开HKEY_LOCAL_MACHINE\MICROSOFT\Windows\CURRENTVERSION\Run，选中右边窗口中的Windows初始化后自动加载程序，将它删除；点击并展开HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\MICROSOFT\Windows\CURRENTVERSION\RunServices，选中右边窗口中的Windows启动时自动加载程序，将它删除。
3、取消系统启动系列中的时间延时
打开“资源管理器”→“编辑”→“文件夹项”→“属性”→设为查看所有文件，退出，在Windows 98启动盘根目录下找到Msdos.sys，在这个文件上右键单击它，并从弹出菜单中选取“属性”项，去掉“只读”和“隐藏”属性，然后单击确定，再用Notepad打开Msdos.sys，在[Options]下，输入一行Boot Delay=0(表示延时0秒)，关闭记事本并保存所做修改，恢复其“隐藏”和“只读”属性，退出并重新启动Windows。
六、加快系统关机速度
可能我们已经感受到Windows的关机要等很上几分钟甚至关不了机，怎么办呢？通过以下办法可以解决。
编辑注册表，在\HKEY_LOCAL_MACHINE\System\Courrent-ControlSet\Control\Shutdown 下创建一个名为 FastReboot 的字符串键，键值为1即可。也可以通过运行Windows实用配置文件msconfig，或是通过点击“开始” →“程序” →附件→系统工具→系统信息，选择工具菜单中的“系统配置实用程序”，点击“高级”按钮，选中“如果关机失败，请禁用磁盘扫描程序”，并不选中“禁用快速关机”即可。
