如果在展开的组中选择任意层，然后点击新建组按钮，将会建立一个新的下级组。如下左图。如果选择层组点击新建组按钮的话会建立一个平级的新组。如下右图。因此在点击新建组按钮前，要想清楚是建立下级组还是平级组。
除此之外，也可以在图层调板中将一个组拖入另一个组，成为下级组。要把一个图层或层组拖入目标层组，目标层组无论是折叠或展开状态均可。如果目标层组是折叠的，将其拖动到层组名字上即可归入，将归入到层组中的最底层。
（ 下图为动画演示，请按从右键菜单中选择“播放”以重新观看）。 可以将图层组中的所有层合并为一个普通层，方法是选择图层组后，点击图层调板圆三角按钮，选择合并图层组，看到快捷键也是〖CTRL E〗。这就是第三种使用前提了：选择图层组时使用〖CTRL E〗将合并组中所有图层。注意合并图层组将会丢弃原先组中隐藏的层。
最后要注意的是，层组内部之间各图层仍保留通常的层次关系。层组与层组之间另外有着整体的层次关系。对齐功能也对层组有效。
我有一位同学在外地任公司人事部经理，一次需要招聘网页设计人员，遂请我出考核题目。我做了一个页面内容较多，但技术上没什么难度，几乎人人都做得出来的网页效果，合并图层后通过网络发去作为范本，要求应聘者模仿制作。后来他按照我的要求将30多份应聘者制作的源文件给我发来。很快我便选定了一位MM，告诉他说她是应聘者中最熟练的，工作效率最高。对此他有些疑惑，因为他看过全部人的作品，感觉没有多少区别。为此还颇有微词，认为题目的技术要求太一般，人人都会做，根本比不出孰优孰劣。
后来我解释我的理由：我在Photoshop中逐一打开源文件观看，不看页面的实际效果，因为我知道那没有难度。我重点看他们的图层组织。这位MM的图层组织最合理。图层组织合理又怎么样呢？他还是不解。于是我继续解释：合理的图层组织非常重要。首先，构成网页的图像细节很多，且多有重复。使用图层组复制可以快速地制作差别不大的各个部分。再者，可移交性在团队合作中是很重要的，良好的图层组织使别人可以较容易看懂源文件并接手工作。最后，合理的图层组织说明操作者有清晰明朗的制作思路，是一个富有经验的成熟的设计师。
