另外需要说明的一点是，信息的透明和安全是一对矛盾的两个方面。人力资源管理系统的安全性设计使得机密的人事薪资信息处在一种“受控”状态下的透明。只有得到系统授权的用户才可以访问被允许获取的信息。因此，我们不需要担心会因为采用人力资源管理系统而降低了人事薪资信息的保密性，相反，信息的安全性会因为人力资源管理系统的采用而得到加强。
四、HRMS的实施
企业在实施HRMS之前，首先要对自身作一个客观而充分的评估，然后确定将要实施的HRMS的范围与边界，从自身实际情况出发，尽可能做到量体裁衣。在了解自己的需求之后，就要选择一家合适的解决方案供应商。HRMS解决方案的实施过程绝不是简单的产品买卖过程，应该视其为一个完整的项目。
项目的实施过程将分为三个阶段：
1、实施前与供应商配合进行需求分析与流程设计阶段：
这个阶段往往会占据整个项目实施周期一半以上的时间，对HR管理者来讲，是一个难得的整理与完善HR管理运作体系的过程，有利于将以往离散的工作规范化、系统化。对供应商来讲，事先将客户的需求理顺，对整个项目的顺利实施也起着决定性作用。因此，用户与供应商都应认真对待这一阶段的工作，而不应急于马上就要看到系统运行的效果。
2、系统实施与客户化改造阶段：
需求分析与设计阶段完成后，供应商将会根据用户的特殊需求对系统进行定制化改造，这期间，用户应与供应商之间保持频繁的沟通，避免用户需求在定制化过程中走样。供应商在完成所有功能的开发后，提交给用户的，还只是一个系统框架，并不能马上运行，用户还需要在供应商的帮助下进行系统初始化与数据转换工作，使企业基础数据与员工基础数据在尽可能短的时间内迁移到系统中来。此外，企业在系统正式运行前应接受供应商关于使用系统的相关技能培训。
3、系统应用培训阶段：
实施过程中，企业应根据自己业务的具体特点，向软件供应商提出改进及增设相应模块的要求，软件供应商应积极进行跟进作二次开发的工作，确保能满足企业不断变化的管理要求。
五、如何选择HRMS系统
企业在选择HRMS时，技术服务、产品价格、产品知名度等容易根据经验判断得出结论；而对于产品的性能特色、二次开发功能等，若没有适当的标准作指导，就不太好把握。好的HRMS应该是一套高效率、多功能及易学易用的解决方案，用户在选择系统时可从以下一些特征评判其功能：
1、完整性与集成性
·全面涵盖人力资源管理的所有业务功能，且每个业务功能都是基于完整而标准的业务流程与大量配套表格来设计，是用户日常工作的信息化管理平台
·对员工数据的输入工作只需进行一次，其他模块即可共享，减少大量的重复录入工作
·既可作为一个完整的系统使用，也可将模块拆分单独使用，在必要时还能扩展集成
2、易用性
·采用导航器界面，友好简洁，直观体现HR管理者的主要工作内容，且能引导用户按照优化的HR管理流程进行操作
·基本没有弹出式对话框，一个界面就能显示所有相关信息，并操作所有功能，信息集成度高
3、网络功能与自助服务
·支持集团型企业用户，提供异地、多级、分层的数据管理功能
·日常管理不受物理位置限制，可在任何联网计算机上经身份验证后进行操作
·为非HR部门人员提供基于Web的企业内部网络应用
·员工在允许权限内可在线查看企业及个人信息，注册内部培训课程、提交请假／休假申请，更改个人数据，与HR部门进行电子方式的沟通
