『新蜀山剑侠传』的战斗，要比一般回合制的战斗还要热闹有趣。飞剑攻击可以视为一种持续的攻击，藉此不断削减对手的生命。玩者还可指定特定目标承受多数之伤害力，使其提早出局，因而降低敌方对我方之威胁性。而在飞剑相斗同时，尚有多种法宝与特殊招式可以运用，玩者可以选择加强飞剑的持续攻击伤害的辅助攻击法宝，藉以增快对手生命降低的速度，或是干脆选用直接伤害敌人的攻击用法宝。而遇到较为难缠的对手，还可以运用各种状态攻击法宝予以牵制，增加己方战斗优势。