在这个不安全的时代，安全方面的威胁似乎无处不在。在机场，即便是老妇人和小女孩，也得脱下鞋子，接受X射线仪器的检测。除非经过证明，任何人都是被怀疑的对象。而早期的SAN技术，在进入数据中心之前并没有对数据进行严格的检查，在新环境下面临着严重的安全问题。SAN安全产品厂家NeoScale系统公司称："可用性意味着风险"。存储区域网络能够共享存储资源，这个事实，使得SAN具有潜在的不安全性，并成为不法分子的攻击目标。
同大多数公司网络一样，主要的安全威胁不是来自外部的不法分子，而是源自内部：无聊的或者心怀不满的员工，或者粗心的管理员无意中开放了对部门数据的访问权限。因为SAN在重要的公司数据存放之处创建了邻居区域，所以，一个安全的SAN应该设置防护和验证措施。实际上，除了对SAN进行简单的物理隔离之外，很少有公司采取进一步的防护措施。位于数据中心的密码锁后面的SAN只能对付一些好奇的访客，但要对付那些了解机关，并打算入侵的不法之徒，SAN仍然具有安全隐患。
除此之外，并不是所有的东西都存放在数据中心。例如，需要经常开着箱式货车或者卡车，驶过公共道路，把海量的公司数据运到传统的磁带仓库里。用于管理SAN的局域网可能同数据中心不在一起，且连接到公司的LAN或者WAN中。对于后面的这种情况，也许数据中心外面的人员不能直接访问存储数据，但如下的这些可能性存在：使用管理工具重新划分服务器和存储设备的范围，开放受限数据的访问权限，或者通过重置SAN交换机，执行拒绝服务攻击。
